I have three lists of data: X,Y,Z and trying to generate a 3d trisurf plot (i did both in MATLAB and in Python) with them.
The problem is the plot seems to lose something, in MATLAB it's K = boundary(X,Y,Z,1); trisurf(K, X, Y, Z, 'FaceAlpha', 0.1).
trisurf in Python (matplotlib):
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits import mplot3d
%matplotlib inline
# data (X,Y,Z) for three-dimensional scattered points: **in the end of this post**
# plot
fig = plt.figure(figsize=(20,15))
ax = plt.axes(projection='3d')
ax.plot_trisurf(X, Y, Z,
cmap='viridis', edgecolor='none');
ax.set_xlabel('kp')
ax.set_ylabel('ki')
ax.set_zlabel('pcg of min time delay (%)')
ax.set_title("f-t curve(s)")
Before using MATLAB, we need to use Python to put the data into a csv file:
df = pd.DataFrame.from_dict({'kp':X, 'ki':Y, 'pcgTd (%)':Z})
df.to_csv('cur.csv', header=False, index=False)
In MATLAB, we can use:
% if you store data in a csv file
num = xlsread('YOUR_ADDRESS/cur.csv', 'A2:C518');
X = num(:,1);
Y = num(:,2);
Z = num(:,3);
K = boundary(X, Y, Z, 1);
trisurf(K, X, Y, Z, 'FaceAlpha', 0.1)
colorbar
xlabel('kp')
ylabel('ki')
zlabel('delay (sec)')
xlim([0.05 3.2]);
ylim([0.01 0.06]);
zlim([100 200]);
set(gca,'XTick',[0.05:0.05:3.2])
set(gca,'YTick',[0.01:0.01:0.06])
set(gca,'ZTick',[100:50:200])
How can I fix the 3d plot problem in Python (boundary or ...)?
matplotlib version:
MATLAB version (goal):

p.s., basically, the 3d plot is based on three 2d layers (Z=100,150,200), and you can see, from MATLAB diagram and from the three 2d diagrams, the dots are shrunk if Z is higher.

Data: X = [0.05, 0.1, 0.1, 0.1, 0.15, 0.15, 0.15, 0.15, 0.15, 0.15, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.2, 0.25, 0.25, 0.25, 0.25, 0.25, 0.25, 0.25, 0.25, 0.25, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.3, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.35, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.4, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.45, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.5, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.55, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.6, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.65, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.7, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.85, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.9, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.0, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.05, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.1, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.15, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.2, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.25, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.3, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.35, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.4, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.45, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.5, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.55, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.6, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.65, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.7, 1.75, 1.75, 1.75, 1.75, 1.75, 1.75, 1.75, 1.75, 1.75, 1.75, 1.75, 1.8, 1.8, 1.8, 1.8, 1.8, 1.8, 1.8, 1.8, 1.8, 1.8, 1.85, 1.85, 1.85, 1.85, 1.85, 1.85, 1.85, 1.85, 1.85, 1.85, 1.9, 1.9, 1.9, 1.9, 1.9, 1.9, 1.9, 1.9, 1.9, 1.95, 1.95, 1.95, 1.95, 1.95, 1.95, 1.95, 1.95, 1.95, 2.0, 2.0, 2.0, 2.0, 2.0, 2.0, 2.0, 2.0, 2.05, 2.05, 2.05, 2.05, 2.05, 2.05, 2.05, 2.1, 2.1, 2.1, 2.1, 2.1, 2.1, 2.1, 2.15, 2.15, 2.15, 2.15, 2.15, 2.15, 2.2, 2.2, 2.2, 2.2, 2.2, 2.2, 2.25, 2.25, 2.25, 2.25, 2.25, 2.3, 2.3, 2.3, 2.3, 2.35, 2.35, 2.35, 2.35, 2.4, 2.4, 2.4, 2.45, 2.45, 2.5, 2.55]
Y = [0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.05, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.05, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.04, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.03, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.03, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.03, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01]
Z = [100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 100.0, 150.0, 200.0, 100.0, 150.0, 100.0, 100.0]